醫院廢水處理設備采用國際先進的生物處理工藝 ，在總結國內外生活廢水處理裝置的運行經驗的基礎上 ，設計出一種可地埋設置的成套有機廢水處理裝置 ，集去除BOD5 、COD 、NH3-N於一身 ，具有技術性能穩定可靠 、處理效果好 、投資省 、自動化運行 、維護操作方便 、不需蓋房 、不需采暖保溫等優點 。占地麵積小 ，不影響周圍環境 。

此裝置一般埋設於地表之下，運用二次生物接觸氧化處理工藝 ，它處理的效果超越全混合生物氧化池 ，對水質的適應性強度高 ，保證了水處理的穩定性 。該設備在池中采用了新型強效彈性立體填料 ，對汙水中的有機物質具有強效去除的功能 。該設備通過氧化處理之後 ，產生的汙泥量較少 ，僅需90天排放一次即可。為了避免放生病菌滋生 、傳播的現象發生 ，必須對水質進行深度消毒處理 。目前應用最多的消毒工藝有：紫外線消毒 、二氧化氯消毒 、臭氧消毒 。醫院需根據汙水水質特點及排放量進行選擇 。

醫院汙水處理主要是消毒 ，即殺滅病原體 。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒(見水的消毒 、廢水氧化處理法） 。